山東農業大學前身是1906年創辦于濟南的山東高等農業學堂。后幾經變遷山東農業大學研究生院，1952年經全國院系調整，山東省立農學院與當時的山東大學農學院合并山東農業大學研究生院，同時調入齊魯大學農業專科、金陵大學園藝系、南京大學園藝系果樹組，組成了新的山東農學院，校址在濟南。
1958年由濟南遷至泰安，1983年更名為山東農業大學。1999年7月，原山東農業大學、山東水利專科學校合并，同時山東省林業學校并入，組建新的山東農業大學。學校研究生教育始于1954年，1981年成為全國首批碩士學位授權單位，1986年開始招收博士研究生。
截至2023年2月，學校校園占地面積5340.13畝，建筑面積118.13萬平方米；設有21個學院，開設90個本科專業；有在校生34546人，其中本科生28967人，博士、碩士研究生5579人，繼續教育類學生23925人，教職工2531人。
截至2023年2月，學校設有21個學院，開設90個本科專業，學科專業以農業科學為優勢，生命科學為特色，融農、理、工、管、經、文、法、藝術學等于一體的多科性大學。
截至2023年2月，學校有12個博士后科研流動站，12個一級學科博士點，26個一級學科碩士點、15個專業學位授權類別；2個國家重點學科，2個農業農村部重點學科，21個省級重點學科；1個省“高峰學科”，4個省“優勢特色學科”。
1個省培育學科；1個省一流學科“高峰計劃”建設學科，4個省一流及培育學科，農林學科連續6年入選QS世界大學學科排行榜400強，5個學科進入ESI全球排名前1%，其中植物與動物科學學科進入ESI全球排名前1‰。
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