學院全日制教育的管理實行院、系(部)二級模式，其中設有經濟管理系，設有電氣與機械工程系，設有計算機與信息工程系，設有生物工程系，設有建筑工程系，設有外語系，設有人文科學系，設有旅游系，有體育系，還有思政課部，這些是10個系(部)，另外有國家職業技能鑒定所、圖書館等教學輔助機構。

學院當前有在崗教職工五百七十一人，其中教師四百一十八人。教師里頭，有研究生學歷或者碩士學位的八十五人恩施職業技術學院，正教授八人，副教授一百四十五人，雙師素質教師二百二十一人，常年聘請企業兼職教師三百二十一人，享受國務院津貼專家一人，全國職業教育名師一人，湖北名師一人，楚天技能名師七人，恩施州突出貢獻專家一人，恩施州高技能人才二人。在校內，擁有 103 個實驗實訓室，3 個生產性實訓基地，75 個多媒體教室，7 個語音室，還有 1373 臺教學用計算機，已建成四個國家職業教育實訓基地，分別是“數控技術”、“計算機及應用”、“生物技術”、“建筑工程技術”，還建成三個省級示范實訓基地，即“畜牧獸醫”、“生物制藥技術”、“旅游管理”，800 元以上的教學儀器設備值達到 3800 余萬元，校企共建校外實習基地 220 個 。現在開設了高職專業34個，當中有省級重點專業2個，省級示范專業3個，省級教改專業3個，已經建成省級教學團隊2個，省級精品課程7門。在長時間的辦學實踐當中，學院以湖北民族地區為立足之地，緊密圍繞恩施州區域經濟發展情況，提出了“一二三四”的辦學指導思想，其中，“一創”目標是：創建特色鮮明的示范高職院校；“兩為”宗旨是：為學生職業生涯發展奠定基礎，為民族地區經濟社會發展提供支撐；“三融”模式是：教育與產業相融合，學校與企業相融合，學習與工作相融合；“四院”方略是：質量立院，特色興院，人才強院，依法治院。建立了“立足恩施，輻射武陵，面向市場，開放辦學”這樣的辦學指導方針，塑造出“植根湖北西部地區，服務民族經濟發展”如此的辦學特色 。

學院堅持走內涵發展那種由對接產業、依托行業形成的，建立起“1333”校企共育、工學交融、能力遞進人才培養模式的路，此模式為：人才培養上有一個本位，是以職業能力作為本位，校企共同去確定專業人才培養標準；課程構造存在三個模塊，是校企共同開發專業支撐課程、專業核心課程以及專業拓展課程這三個模塊化課程；能力提升有三個層次，是校企共同實施職場體驗實習、專業頂崗實習還有就業頂崗實習；培養過程有三個結合，分別是校內學與做（訓）結合，校內培養與校外培養進行結合，校內考核和企業考核相結合。秉承“抓頂層系統設計，強過程質量監控，提專業內涵發展，評判人才培養質量”的建設思路，引入社會評價，構建起“雙方參與、雙向督導、雙向評價、雙向反饋”的教學質量保障體系，也就是行業企業專家參與創建院、系二級督導，推行以企業評價為主體的學院、企業雙向評價，以及雙向信息反饋。秉持“育人為本、德育為先”，施行“形式多樣、全程貫穿”的職業素質教育，構建了“155”學生素質教育體系，當中一個宗旨是提高學生綜合職業能力和職業素質，五個平臺為課程、隊伍、基地、校園文化、管理，五項工程是文明修身、學風建設、恩施民族文化進校園、社會實踐鍛煉、就業創業推進。圍繞“三農”需求，圍繞行業需求，圍繞企業需求恩施職業技術學院，持續不斷創新體制機制，構建起“一二二”社會服務能力體系，那便是打造一個平臺，此平臺依托四個中央財政予以支持的實訓基地，依托三個省級示范實訓基地，進而打造科技服務平臺；建設兩支隊伍，一支是企業服務隊伍，另一支是“三農”服務隊伍；實施“雙百”項目，一個是百名教師進企業活動，另一個是百項技術服務項目。遵循以學生作為根本的原則，建立并完善就業機制，對學生就業予以保障，促使就業質量得以提升，構建起了“333”學生就業服務體系，也就是三促進，具體為政校聯動從而促進就業、校企合作進而促進就業、創業創新以推動就業，還包括三保障，分別是課程、隊伍以及制度，另外有三承諾，即就業推薦、權益保障咨詢、畢業生免費再培訓。

這所學院朝著全國展開招生舉動，當前存在全日制學生八千余人。畢業生就業率一年比一年有所升高，在二零零九年、二零一零年、二零一一年，該學院畢業生的就業率分別各自達成了百分之九十三點四、百分之九十六點零、百分之九十六點六，處于全省內部的高職院校偏前方位置。諸多專業因為其畢業生具備“下得去、留得住、用得上”的特性，從而獲得企業以及用人單位的良好評價態度。旅游管理、畜牧獸醫、建筑工程技術、園林技術等相關專業之中的畢業生就業率全部達到了百分之百。學院秉持這樣的辦學宗旨，即服務地方經濟建設、引領區域產業發展，辦學思路愈發清晰，專業跟產業的銜接更為緊密，綜合辦學實力顯著增強，人才培養質量大幅提高，服務區域經濟的能力持續提升，已然成為湖北西部地區關鍵的高素質、高技能人才培養基地，在湖北西部以及武陵地區高職教育改革發展里發揮重要的示范與引領作用。