內蒙古醫科大學附屬醫院始建于1958年，經過55年的發展建設，已成為內蒙古自治區一所集醫療、教學、科研和預防保健為一體的現代化綜合性三級甲等醫院。醫院現開放床位1804張，年門急診量124萬人次，年出院人數70045人次，年完成手術31350臺例。全院在職職工2896人，其中正高級職稱296人，副高級職稱375人。目前具有博士學歷衛生技術人員106人，享受國務院政府特殊津貼專家41人。醫院現有36個臨床科室，15個醫技科室，44個病區。擁有神經外科學、普通外科、蒙醫科3個國家臨床重點專科；呼吸內科學、普通外科學、胸外科學、婦科學、耳鼻咽喉科學、麻醉學6個自治區臨床醫學領先學科；消化內科學、神經外科學、產科學、兒科學、放射腫瘤學、醫學影像學、臨床檢驗學7個自治區臨床醫學重點學科和1個自治區基礎醫學和預防醫學重點實驗室、以及自治區首家“分子與功能影響工程技術研究中心”在醫院掛牌成立。2009年我院掛牌成為內蒙古醫學院第一臨床醫學院；2013年內蒙古醫科大學口腔醫學院在我院成立并揭牌。醫院是內蒙古自治區臨床醫學一級學科碩士學位授予點，涵蓋二級學科18個。醫院現有博士生導師3名，碩士生導師134名，博士生100名，碩士生570名。

醫院承擔著我院臨床醫學、麻醉醫學、醫學影像學、口腔醫學等專業本科、研究生的學生管理、教學任務。第一臨床醫學院（我院）對管理學生工作十分重視，定期開展學風講座、畢業生模擬面試課堂等活動，目前管理學生2400名。每年接受區內外進修人員1000多人。近五年來，醫院承擔了國家自然科學基金27項和各類省部級科研項目165項，獲科研成果95余項，發表中華系列文章120余篇，SCI收錄文章50篇，總數位居內蒙古自治區衛生系統首位。醫院目前擁有PET/CT、64排CT、3.0T核磁共振、C型臂數字減影血管造影機、ECT機、全數字化彩色多普勒超聲診斷系統、全自動生化分析儀等先進設備內蒙古醫學院，在質量和數量上均屬區內領先。醫院設有外臨床醫學研究中心、外科實驗室、干細胞臨床應用實驗室、新藥臨床機構辦公室等國內一流的臨床醫學研究中心，為醫院研究人員進行醫學科學研究提供良好的平臺。醫院近年制定出臺《內蒙古醫科大學附屬醫院特聘教授實施細則（試行）》、《內蒙古醫科大學附屬醫院客座教授聘任辦法(試行)》等，聘請有特長的知名專家作為特聘教授，來院進行業務和科研指導。醫院不斷加強國內、國際間交流，定期派出專業人員到國內外學習深造，邀請國內外知名專家來院講學，先后與美國、日本、蒙古、臺灣、香港等國家和地區建立了技術合作交流與人才培養協議。

近年來，醫院先后與區內12個盟市的一百多個旗、縣、區二級醫院組成了以技術協作為主，松散型的“附屬醫院醫院集團”。截止目前，醫院集團成員已達110家內蒙古醫學院，并建立了“遠程醫療會診網絡”。2008年，我院對二連浩特市醫院進行托管，成立了內蒙古醫科大學附屬醫院二連浩特分院，運行以來，醫院的社會效益、經濟效益有了新的提高。目前，醫院以自己的實際行動踐行著“精醫厚德、福澤民眾”的院訓精神，正在為建設成自治區布置合理、學科特色鮮明、醫療質量過硬、部分專業技術在國內有一定影響力的自治區區域醫療中心而奮斗。