1978年4月阿富汗民主共和國建立，塔拉基擔(dān)任革命委員會(huì)主席，并兼任總理。塔拉基在執(zhí)政期間，國內(nèi)矛盾錯(cuò)綜復(fù)雜，政府重組不斷。1979年3月，阿明被任命為政府總理，但他不受蘇聯(lián)所歡迎。蘇聯(lián)企圖聯(lián)合塔拉基搞掉阿明，但阿明卻捷足先登發(fā)動(dòng)政變，處死了塔拉基，自己兼任總統(tǒng)。阿明政府執(zhí)政時(shí)期，國內(nèi)政局動(dòng)蕩，而且人民黨內(nèi)部也是互相傾軋。蘇聯(lián)認(rèn)識(shí)到，阿明政權(quán)不能實(shí)現(xiàn)蘇聯(lián)在阿富汗的利益，決定實(shí)施南下戰(zhàn)略，除掉阿明。
1979年蘇聯(lián)軍隊(duì)對(duì)阿富汗的全面入侵。70年代蘇聯(lián)為從陸路南下印度洋，對(duì)阿富汗進(jìn)行滲透和擴(kuò)張。 1979年12月27日，蘇聯(lián)派遣8萬多人的現(xiàn)代化軍隊(duì)，大舉侵入阿富汗，占領(lǐng)了阿富汗首都喀布爾及其他大城市，處決9月通過政變上臺(tái)的阿明，在蘇境內(nèi)播發(fā)所謂阿富汗政府請(qǐng)求蘇聯(lián)援助的聲明。早已集結(jié)在邊境上的蘇軍大舉入侵，一周之內(nèi)控制了主要城市和交通干線，并扶植人民民主黨旗幟派頭目卡爾邁勒組成傀儡政權(quán)，由卡爾邁勒擔(dān)任阿富汗人民民主黨總書記、阿富汗革命委員會(huì)主席和政府總理等職。蘇聯(lián)入侵后，阿富汗人民奮起抵抗。十幾支穆斯林愛國武裝在喀布爾市郊、坎大哈、赫拉特和全國的山區(qū)要塞展開了抗蘇斗爭。
1981年，其中的幾個(gè)抵抗組織聯(lián)合成立了阿富汗圣戰(zhàn)者伊斯蘭聯(lián)盟，并開始接受美國、巴基斯坦、沙特阿拉伯和埃及等國的軍事援助，在全國開展抵抗蘇軍入侵的斗爭。
蘇軍入侵阿富汗，還遭到了世界大多數(shù)國家的強(qiáng)烈譴責(zé)。1980年1月，聯(lián)合國第六屆特別會(huì)議通過了《要求外國軍隊(duì)無條件和全部撤出阿富汗》的決議。以后歷屆聯(lián)合國大會(huì)上，蘇聯(lián)都遭到各國的強(qiáng)烈譴責(zé)，要求蘇軍撤出阿富汗，實(shí)現(xiàn)政治解決阿富汗問題。蘇軍的入侵，給阿富汗人民帶來了深重的災(zāi)難。蘇軍進(jìn)入后，阿富汗遭到了極大破壞，大約100萬人死于戰(zhàn)火，600萬人被迫逃離家園，淪為難民。
1986年2月，在阿富汗人民的頑強(qiáng)抵抗和世界輿論的強(qiáng)烈譴責(zé)下，蘇聯(lián)被迫表示，愿意政治解決阿富汗問題。5月，納吉布拉代替卡爾邁勒，擔(dān)任人民民主黨總書記一職。12月，納吉布拉被任命為革命委員會(huì)主席。第二年，又擔(dān)任了總統(tǒng)。1988年，在聯(lián)合國秘書長德奎利亞爾的主持下，蘇聯(lián)、美國、阿富汗喀布爾政權(quán)和巴基斯坦四國外長在日內(nèi)瓦簽署了政治解決阿富汗問題協(xié)議。協(xié)議包括四項(xiàng)文件和一項(xiàng)關(guān)于聯(lián)合國提供監(jiān)督的備忘錄，要求巴基斯坦和阿富汗喀布爾政權(quán)互不干涉內(nèi)政、阿富汗難民自愿返回家園，以及由美、蘇提供國際保護(hù)。協(xié)議還規(guī)定，蘇軍從1988年5月15日起，9個(gè)月內(nèi)全部撤出阿富汗。1989年2月15日，蘇軍按照協(xié)議規(guī)定全部撤出了阿富汗。1991年5月，聯(lián)合國提出了阿富汗和平計(jì)劃，建議成立多黨政府。1992年4月16日，納吉布拉政權(quán)瓦解。28日，穆賈迪迪在喀布爾成立了阿富汗伊斯蘭國臨時(shí)政府。